Inazuma Eleven Go: Chrono Stone

Inazuma Eleven Go: Chrono Stone berlatar setelah Turnamen Sepak Bola Holy Road. Tokoh utama di masa itu, Tenma Matsukaze, bepergian ke seluruh Jepang untuk mengajar sepak bola kepada anak-anak. Ia kembali ke SMP Raimon setelah menyelesaikan misinya, tetapi yang mengejutkannya, SMP Raimon itu tidak lagi sama seperti yang ia ingat. Klub sepak bola itu tidak ada lagi, dan anggota tim juara di Turnamen Sepak Bola Holy Road tidak ingat pernah ikut serta dalam turnamen itu. Mereka tidak ingat Tenma maupun permainan sepak bola yang mereka sukai. Saat Tenma bingung dengan perubahan ini, Alpha, pemimpin Agen Rute dan kapten tim Protocol Omega, tiba-tiba muncul di hadapannya. Alpha menyatakan bahwa ia dan timnya bertanggung jawab atas hilangnya gairah sepak bola di Raimon beserta ingatan anggota klub sepak bola: dan Tenma sendiri adalah target berikutnya. Saat itulah seorang anak laki-laki aneh bernama Fei Rune muncul tepat pada waktunya untuk menyelamatkannya. Siapakah Fei, dan mengapa Alpha ingin menghilangkan sepak bola untuk selamanya? Tenma tahu bahwa ia harus melakukan segala daya untuk menang. Ini adalah pertarungan yang dapat menentukan nasib sepak bola selamanya.