Ninja Batman

Di Arkham Asylum, Batman berkonflik dengan Gorilla Grodd saat mencoba menghancurkan penemuan terbaru Grodd: Mesin Gempa. Di tengah kekacauan, mesin tersebut aktif, dan seluruh rumah sakit jiwa tiba-tiba lenyap begitu saja—Batman pun ikut lenyap. Setelah debu mereda, Batman mendapati dirinya berdiri di tengah jalan yang asing. Ia segera menyadari bahwa ia tidak lagi berada di Gotham City—melainkan di Jepang Feodal! Keheranannya segera sirna ketika para samurai menyerbunya, berusaha membunuhnya. Kemudian, penyelidikan Batman membawanya menemukan bahwa orang yang bertanggung jawab atas perintah pembunuhan itu tidak lain adalah musuh bebuyutannya, Joker. Setelah bertemu dengan Catwoman, ia mengetahui bahwa para penjahat di rumah sakit jiwa tersebut telah berteleportasi ke sana dua tahun sebelumnya—masing-masing menguasai sebagian wilayah Jepang dengan Joker sebagai panglima perang yang dominan. Untuk kembali ke rumah, Batman harus mengaktifkan kembali Mesin Gempa, yang terletak di reruntuhan rumah sakit jiwa, yang sekarang dikenal sebagai Kastil Arkham. Namun, ada satu masalah: selain sabuk peralatan canggihnya, persenjataan yang dulunya ada di ujung jarinya hampir semuanya hilang. Ninja Batman mengikuti Ksatria Kegelapan saat ia menjelajahi lingkungan baru yang aneh, menghadapi musuh-musuh yang sudah dikenal dalam upaya untuk kembali ke Gotham dengan selamat.